<DIV>
<DIV>Dear CPMD users<BR><BR>I have a very simple question: once a CPMD run is through, the<BR>trajectories in VMD environment look to have extra line as if some <BR>atoms are bonded by more than their bonds by more than their valance bond. <BR>For example, an H atom is bonded to other three C atoms. This is the case <BR>for other elements.<BR><BR>The input file representing the molecule is originally made in <BR>HYPERCHEM, and then operated for appropriate coordinate in GAUSSIAN 98 where it<BR>allows the input file for CPMD be formatted suitably.<BR><BR>It might be due by the representation and not really extra bonds are<BR>involved. Could any of you give comment on this!<BR></DIV></DIV><p>
                <hr size=1>Do you Yahoo!?<br> 
Yahoo! Search presents - <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=30648/*http://movies.yahoo.com/movies/feature/jibjabinaugural.html">Jib Jab's 'Second Term'</a>